Contexte Métier
Dans le cadre d'un essai clinique, des mesures physiologiques (température) sont collectées. Ces mesures peuvent avoir de légères imprécisions. De plus, les codes d'effets secondaires doivent être affichés dans un ordre de gravité spécifique, et non par ordre alphabétique. On veut aussi s'assurer qu'un format critique ne peut pas être écrasé par erreur.
Préparation des Données
Création d'une table `ESSAI_CLINIQUE` avec des températures (certaines légèrement hors des bornes exactes) et des codes d'effets secondaires, incluant une valeur pour 'non applicable'.
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| 1 | DATA casuser.ESSAI_CLINIQUE; |
| 2 | INPUT ID_Patient $ Temperature Code_Effet; |
| 3 | DATALINES; |
| 4 | P01 36.8 3 |
| 5 | P02 38.6 1 |
| 6 | P03 37.59 2 |
| 7 | P04 39.1 1 |
| 8 | P05 37.0 999 |
| 9 | ; |
| 10 | RUN; |
Étapes de réalisation
1
Création de la bibliothèque de formats 'pharmaLib'.
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| 1 | PROC CAS; |
| 2 | sessionprop.addFmtLib fmtLibName="pharmaLib"; |
| 3 | RUN; |
2
Ajout d'un format 'StatutTemp' avec une tolérance (fuzz) pour gérer les imprécisions de mesure.
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| 1 | PROC CAS; |
| 2 | sessionprop.addFormat |
| 3 | fmtLibName="pharmaLib" |
| 4 | fmtName="StatutTemp" |
| 5 | fuzz=0.1 |
| 6 | ranges={"low-37.5='Normal'", "37.6-38.5='Subfébrile'", "38.6-high='Fièvre'"}; |
| 7 | RUN; |
3
Ajout d'un format 'GraviteEffet' avec un ordre non trié pour préserver la logique métier.
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| 1 | PROC CAS; |
| 2 | sessionprop.addFormat |
| 3 | fmtLibName="pharmaLib" |
| 4 | fmtName="GraviteEffet" |
| 5 | notSorted=true |
| 6 | ranges={"1='Grave'", "2='Modéré'", "3='Léger'", "999='Non Applicable'"}; |
| 7 | RUN; |
4
Tentative de remplacement du format 'GraviteEffet' avec `replace=false`. Cette étape doit générer une erreur dans le log SAS.
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| 1 | PROC CAS; |
| 2 | sessionprop.addFormat |
| 3 | fmtLibName="pharmaLib" |
| 4 | fmtName="GraviteEffet" |
| 5 | replace=false |
| 6 | ranges={"1='Erreur'"}; |
| 7 | RUN; |
5
Application des formats valides pour vérification.
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| 1 | PROC casutil; |
| 2 | load casdata="ESSAI_CLINIQUE" casout="ESSAI_CLINIQUE_FORMATE" replace; |
| 3 | setSessOpt caslib="casuser"; |
| 4 | alterTable |
| 5 | TABLE={name="ESSAI_CLINIQUE_FORMATE"} |
| 6 | columns={{name="Temperature", FORMAT="StatutTemp"}, {name="Code_Effet", FORMAT="GraviteEffet"}}; |
| 7 | fetch TABLE={name="ESSAI_CLINIQUE_FORMATE"}; |
| 8 | RUN; |
Résultat Attendu
La température 37.59 doit être formatée en 'Subfébrile' grâce au paramètre `fuzz`. Les codes d'effet doivent être affichés selon l'ordre défini ('Grave', 'Modéré', 'Léger'). L'étape 4 doit échouer et un message d'erreur doit indiquer que le format existe déjà, confirmant le bon fonctionnement de `replace=false`.